Le Professeur Chouillard est chirurgien des hôpitaux (diplômé depuis 1996), ancien chef de service de chirurgie digestive et générale du centre hospitalier de Poissy/Saint -Germain-en-Laye.

Le Professeur Chouillard est qualifié en chirurgie mini-invasive et sans cicatrices, ainsi qu’en obésité et cancérologie. Il a dirigé de 2012 à 2022 le centre spécialisé en obésité (CSO) de Paris/Île-de-France ouest.

Le Professeur Chouillard est spécialisé dans les interventions suivantes :
- chirurgie mini-invasive et sans cicatrices des organes abdominaux ;
- hernies, éventrations, vésicule biliaire, reflux gastro-œsophagien ;
- cancers (côlon, grêle, rectum, estomac, œsophage, foie, voies biliaires) ;
- chirurgie de la carcinose péritonéale (chimio-hyperthermie intrapéritonéale) et des tumeurs abdominales étendues ;
- maladies inflammatoires de l’intestin (maladie de Crohn, rectocolite hémorragique) ;
- chirurgie de l’obésité et des maladies métaboliques (endoscopie chirurgicale, anneau, sleeve, plicature gastrique, bypass gastrique en Y, bypass gastrique en oméga, dérivations bilio-pancréatiques) ;
- reprise et complications de la chirurgie de l’obésité (fistule, sténose, reprise de poids) ;
- chirurgie réparatrice abdominale, des membres et du tronc et relooking après amaigrissement.

Le Professeur Chouillard est président de la société internationale de chirurgie iNOELS. Il est membre de plusieurs sociétés savantes françaises, européennes et américaines. Il est professeur associé dans plusieurs universités internationales. Il donne des cours en France et à l’étranger. Il est auteur de 3 livres, plus de 150 publications dans des livres ou journaux scientifiques internationaux et de plus de 500 communications ou conférences partout dans le monde.